超劇場版ケロロ軍曹3 ケロロ対ケロロ 天空大決戦であります!
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地球(ペコポン)侵略の使命(ミッション)そっちのけで危機を救ってきたケロロの前に最強の敵(ケロロ)が!?
未だ地球侵略を果たせないばかりか、冬樹や夏美との交流を深めるケロロ軍曹と小隊。ところが、インカ帝国の遺跡マチュピチュへの旅で、迷路のような遺跡を発見したことから思いもかけない闘いに巻き込まれてしまう。ケロロにそっくりな”ダークケロロ“率いる冷酷な敵、謎の少女ナスカなど劇場版限定キャラクターにも大注目。同時上映・短編の主題歌は、人気のお笑いコンビ・藤崎マーケット。